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Se trata del Sisgen-VIH, un sistema que permite analizar secuencias y mutaciones del ADN del virus en conjunto con datos clínicos y genéticos de los pacientes

El Laboratorio de Biología Celular y Retrovirus del hospital Garrahan fue el que desarrolló el Sisgen-VIH (Sistema Informático de Secuencias Genéticas) en conjunto con la Plataforma Bioinformática Argentina (BIA) y con la colaboración de la dirección asociada de Docencia e Investigación y la gerencia de Sistemas del hospital.

Se trata de la primera plataforma que permite analizar secuencias y mutaciones del ADN del virus junto a los datos genéticos y clínicos del paciente, como la carga viral, el tipo de tratamiento aplicado y los resultados de laboratorio. El objetivo es avanzar en líneas de investigación sobre VIH en niños.

La bioquímica e investigadora del Conicet Paula Aulicino, una de las desarrolladoras de la nueva plataforma, explicó que, en términos simples, la nueva herramienta «es una aplicación que permite guardar, recuperar y visualizar las secuencias del virus VIH, vinculadas a los datos del paciente de donde se originó la información: es decir que la novedad es la interconexión de los datos clínicos, genéticos y moleculares de un paciente».

La herramienta toma las secuencias de ADN que deben analizarse y permite organizar y relacionar información biológica de diversas bases de datos públicas y de los sistemas propios del hospital para enriquecer y caracterizar los datos de entrada. Con la plataforma se puede realizar un seguimiento completo del paciente combinando distintos enfoques.

Aulicino detalló que «como no existe cura para el VIH nuestro objetivo de investigación está en el virus, en conocer cada vez más su comportamiento, responder preguntas y abrir nuevas líneas de investigación». El estudio de las secuencias genéticas del virus es útil para guiar el uso de las drogas antirretrovirales en el tratamiento, agregó la especialista.

En la actualidad, el Garrahan atiende a unos 300 niños y niñas con VIH, infectados con el virus desde su nacimiento. «Cada seis meses se realizan el estudio de carga viral del virus y, según el resultado, muchas veces es necesario hacer el estudio de resistencia, es decir la secuenciación del ADN del virus para buscar las mutaciones y combinación de esas mutaciones que lo hacen resistente al tratamiento», explicó la bioquímica.

El problema para los investigadores, que impulsó la creación de la nueva herramienta, era precisamente el resultado del Estudio Molecular de Resistencia, un test de laboratorio que permite identificar mutaciones asociadas a resistencia a través de la secuenciación del ADN del virus. El resultado son unos 1.200 caracteres de la combinación de las cuatro bases del código genético (A,C,T,G), que necesitan una interpretación diferente a cualquier otro estudio de laboratorio.

Antes de la creación del Sisgen-VIH plataforma, los datos se guardaban en un archivo de texto, no relacionado con los otros datos clínicos del paciente.

«Necesitábamos tener los datos asociados porque eso nos permite hacer estudios, abrir líneas de investigación, contestar preguntas sobre la evolución del virus, la relación con la medicación», aseguró la bioquímica. A partir de ahora, con la creación de la plataforma, pueden hacerlo, detalló.

El Sisgen-VIH se está implementando en forma preliminar en el hospital y se espera que en los próximos meses esté a punto para ser utilizado con todos los pacientes con VIH.

Fuente: Infobae.com